Waarschijnlijk is door de aanleg van de stuifdijk tussen Texel en Eierland in 1630 het geulenpatroon op de zeebodem veranderd. Het dorp West-Vlieland kreeg mogelijk hierdoor te maken met sterkere zeestromingen, waardoor het gehele dorp geleidelijk aan in de zee verdween. In 1736 stonden er nog maar twee huizen. Hierna zijn ook de laatste resten van het dorp in zee verdwenen.

Het voormalige dorp West-Vlieland is nu te positioneren in de Noordzee, ten noorden van de Vliehors. Kaarten met daarop de molen zijn vooralsnog niet bekend. Ook anderszins is de positie van de molen ten opzichte van het dorp niet bekend. De coördinaten van het verdronken dorp als geheel zijn wel bekend (bron: wikipedia) en zijn dan ook gebruikt als globale coördinaten voor de molen.