Het bouwjaar van de Middelmolen zal kort voor het jaar 1600 hebben gelegen. Het is niet duidelijk tot welk type deze molen behoorde, maar vermoedelijk betrof het hier een standerdmolen. Ook de Middelmolen werd gebruikt voor het malen van meel voor de beschuitbakkerijen van Wormer en Jisp. In een protocol van notaris Adryaen Dircksz. uit Wormer van 29 april 1631 wordt de molen genoemd, de molenaar van de Middelmolen is dan Claes Dirksz.. Later heeft de molen een tijd lang "de Loen" of "de Loenmolen" geheten.
De bijnaam de Zwarte Arend wordt door dhr.C.Mol genoemd in zijn boek over de geschiedenis van Wormer.
In 1672 wordt het volgende verkocht:"Pieter Cornelisz. Moolenaer voor de eene geregte helft ende Maerten Claesz. Sonder Sorgh voor ¾ in de wederhelft ende Claes Dircksz. Eijgenaer van het resteerende ¼ in de voorsz. helft van de koornmoolen genaemt de Middelmolen verkopen met malcander de voorsz. geheele moolen aen de gemeene coornmolenaers van Wormer, voor de somme van 490 carolus guldens".
De molen werd door de gezamenlijke korenmolenaars van Wormer gekocht om daarna gesloopt te worden.
In welk jaar de molen precies werd gesloopt is onbekend, maar in 1677 verkochten de molenaars, op die van de Arismolen na:"een sevende part in 't erff van de afgebroocken Middelmoolen".
Bronnen:
"Duizend Zaanse molens" P.Boorsma 1968 blz. 184
"Zaanlandsch jaarboek over het jaar 1932" G.J.Honig en S.Lootsma 1932 blz. 205-208
"Zaanlandsch jaarboek over het jaar 1934" G.J.Honig en S.Lootsma 1934 blz. 157-161
"Uit de geschiedenis van Wormer" C.Mol 1966 blz.117-121